Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh2d4aQ9D7V1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh2d4aQ9D7V1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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