Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcc1Q9D4H2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms