Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Iqcf3Q9D498 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Iqcf3Q9D498 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Iqcf3Q9D498 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Iqcf3Q9D498 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Iqcf3Q9D498 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Iqcf3Q9D498 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Iqcf3Q9D498 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Iqcf3Q9D498 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iqcf3Q9D498 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms