Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy3Q9D394 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms