Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf128Q9D304 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms