Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmed11Q9D2R4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms