Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Urm1Q9D2P4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Urm1Q9D2P4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms