Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1lQ9D1E5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1lQ9D1E5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms