Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem53Q9D0Z3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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