Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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