Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mis18aQ9CZJ6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms