Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Xrcc3Q9CXE6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Xrcc3Q9CXE6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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