Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alpk1Q9CXB8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alpk1Q9CXB8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alpk1Q9CXB8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alpk1Q9CXB8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alpk1Q9CXB8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Alpk1Q9CXB8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Alpk1Q9CXB8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Alpk1Q9CXB8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alpk1Q9CXB8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Alpk1Q9CXB8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Alpk1Q9CXB8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms