Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rpusd4Q9CWX4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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