Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx28Q9CWT6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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