Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cnot11Q9CWN7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot11Q9CWN7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms