Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms