Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ykt6Q9CQW1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms