Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms