Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med4Q9CQA5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med4Q9CQA5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Med4Q9CQA5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med4Q9CQA5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med4Q9CQA5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med4Q9CQA5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med4Q9CQA5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med4Q9CQA5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med4Q9CQA5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms