Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms