Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprtQ99M80 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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