Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pagr1aQ99L02 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms