Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q99KU6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q99KU6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q99KU6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q99KU6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms