Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SmagpQ99KC7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms