Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec3Q99J72 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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