Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms