Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn16Q925N4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn16Q925N4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cldn16Q925N4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cldn16Q925N4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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