Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PdgfdQ925I7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms