Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spdl1Q923A2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdl1Q923A2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms