Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q8VCE4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q8VCE4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q8VCE4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms