Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rnf183Q8QZS5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rnf183Q8QZS5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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