Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Casc3Q8K3W3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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