Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc12Q8K2L8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms