Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo18Q8K2I9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fbxo18Q8K2I9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fbxo18Q8K2I9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fbxo18Q8K2I9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fbxo18Q8K2I9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fbxo18Q8K2I9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo18Q8K2I9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms