Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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