Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trip10Q8CJ53 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trip10Q8CJ53 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trip10Q8CJ53 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trip10Q8CJ53 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trip10Q8CJ53 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trip10Q8CJ53 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trip10Q8CJ53 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trip10Q8CJ53 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trip10Q8CJ53 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trip10Q8CJ53 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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