Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms