Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms