Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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