Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc27Q8CD92 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms