Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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