Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms