Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp20Q8C6M1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp20Q8C6M1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp20Q8C6M1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp20Q8C6M1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Usp20Q8C6M1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp20Q8C6M1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp20Q8C6M1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp20Q8C6M1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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