Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NcaphQ8C156 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NcaphQ8C156 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NcaphQ8C156 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NcaphQ8C156 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NcaphQ8C156 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NcaphQ8C156 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NcaphQ8C156 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NcaphQ8C156 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NcaphQ8C156 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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