Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka5Q8C050 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka5Q8C050 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms