Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms