Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6kb1Q8BSK8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6kb1Q8BSK8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6kb1Q8BSK8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6kb1Q8BSK8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6kb1Q8BSK8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps6kb1Q8BSK8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms