Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Smarcal1Q8BJL0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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