Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms